В 1990 году принята на работу в колледж преподавателем музыкально-теоретических дисциплин. 24 года творчески, увлеченно, методически грамотно учила Елена Николаевна своих студентов специальности Музыкальное образование сольфеджио, теории музыки, музыкальной литературе, иллюстрируя излагаемый материал игрой на фортепиано. Стержневая задача курса сольфеджио, по мнению Елены Николаевны, – воспитание навыка точной выразительной интонации, а знание музыкальной литературы невозможно без умения отличать стилистические особенности творчества композиторов.
Елена Николаевна неустанно повышала свой теоретический и научно-практический уровень через курсы повышения квалификации разного уровня. С 1996 года она всерьёз занялась научно-исследовательской работой, связанной с вопросами подготовки учителя музыки, которая завершилась присвоением ей в феврале 2002 года ученой степени кандидата педагогических наук. С этого времени Елена Николаевна – частый участник межвузовских и международных научно-практических конференций. «Научно-педагогическая деятельность О.А.Апраксиной и современные проблемы музыкального образования в вузе», «Теория и практика музыкального образования: исторический аспект, современное состояние и перспективы развития», «Актуальные вопросы музыкальной подготовки в исследованиях студентов» – далеко неполный перечень проблем, по которым выступала Елена Николаевна.
С 1995 года Елена Николаевна возглавляла предметно-цикловую комиссию музыкально-теоретических дисциплин в колледже.
За свой многолетний плодотворный труд Михейченкова Елена Николаевна награждена Почетной грамотой Министерства образования и науки Российской Федерации.